La fracción lipídica está formada por lípidos polares; fosfolípidos y glicolípidos y los lípidos neutros como los triglicéridos, diglicéridos, alquenonas, esteroles y pigmentos. La mayor fracción de lípidos microalgales está constituida por tri- y diglicéridos, los cuales se pueden convertir a biodiesel.
Los lípidos neutros se disuelven en disolventes orgánicos no polares, pero los lípidos polares especialmente los fosfolípidos solo se disuelven en disolventes polares. Por lo que un disolvente ideal para una extracción eficiente debe ser lo suficientemente polar para eliminar los lípidos asociados a la membrana celular y suficientemente no polar para disolver los lípidos neutros, sobre todo los triglicéridos (Xu, 2010).
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